Comme de nombreuses messageries (WhatsApp, Messenger…) Skype se met au chiffrement de bout en bout. Le service, propriété de Microsoft, utilisera le protocole disponible en Open Source, Signal. Il ne sera pas activé par défaut, et les utilisateurs seront obligés de passer en mode « privé » pour que leurs données, et fichiers échangés (photos, vidéos, textes…) ne puissent pas être interceptés. Ainsi, théoriquement, seul le destinataire sera en mesure de les lire.